احتلت جامعة صفاقس المرتبة الاولى مغاربيا بناءً على 11 مؤشراً لقياس أدائها وسمعتها في مجال البحوث الأكاديمية.
ومن خلال تصنيف أفضل جامعات المنطقة العربية احتلت المرتبة 10 عربيا 22 إفريقيا وتسعمائة و 29 عالميا وفق تصنيف موقع U.S News.
وقد تحصلت المدرسة الوطنية للمهندسين بصفاقس على المرتبة الأولى مغاربيا و المرتبة السادسة عربيا والمرتبة 593 عالميا في مجال الهندسة في موضوعات بحثية متعددة كعلوم الفضاء وهندسة الطيران، والهندسة المدنية والكهربائية والميكانيكية. وتُعد هذه المؤسسات الأفضل لدراسة الهندسة في المنطقة العربية، بناءً على أبحاثها في هذا المجال
وفي في مجال البحوث المتعلقة بالعلوم الزراعية والبيولوجية. تضمنت بحوثا حول مواضيع علم الحيوان، وعلم الأحياء المائية، وعلم الغذاء، وعلم البستنة فلقد احتلت المدرسة الوطنية للمهندسين بصفاقس المرتبة الرابعة عربيا.
وبخصوص مجال دراسة علوم الحاسب الآلي (الكومبيوتر) احتلت المدرسة الوطنية للمهندسين بصفاقس المرتبة الخامسة عربيا و التي أثبتت تميزها في إعداد بحوث في هذا المجال بالمنطقة العربية. وتشتمل الموضوعات التي تمت دراستها على كل من نظم المعلومات والتفاعل بين الإنسان والكمبيوتر.
